LCOV - code coverage report
Current view: top level - analysis/vector - qgszonalstatistics.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
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Date: 2021-03-26 12:19:53 Functions: 0 0 -
Branches: 0 0 -

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : /***************************************************************************
       2                 :            :                           qgszonalstatistics.cpp  -  description
       3                 :            :                           ----------------------------
       4                 :            :     begin                : August 29th, 2009
       5                 :            :     copyright            : (C) 2009 by Marco Hugentobler
       6                 :            :     email                : marco at hugis dot net
       7                 :            :  ***************************************************************************/
       8                 :            : 
       9                 :            : /***************************************************************************
      10                 :            :  *                                                                         *
      11                 :            :  *   This program is free software; you can redistribute it and/or modify  *
      12                 :            :  *   it under the terms of the GNU General Public License as published by  *
      13                 :            :  *   the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or     *
      14                 :            :  *   (at your option) any later version.                                   *
      15                 :            :  *                                                                         *
      16                 :            :  ***************************************************************************/
      17                 :            : 
      18                 :            : #include "qgszonalstatistics.h"
      19                 :            : 
      20                 :            : #include "qgsfeatureiterator.h"
      21                 :            : #include "qgsfeedback.h"
      22                 :            : #include "qgsgeometry.h"
      23                 :            : #include "qgsvectordataprovider.h"
      24                 :            : #include "qgsvectorlayer.h"
      25                 :            : #include "processing/qgsrasteranalysisutils.h"
      26                 :            : #include "qgsrasterdataprovider.h"
      27                 :            : #include "qgsrasterlayer.h"
      28                 :            : #include "qgslogger.h"
      29                 :            : #include "qgsproject.h"
      30                 :            : 
      31                 :            : #include <QFile>
      32                 :            : 
      33                 :          0 : QgsZonalStatistics::QgsZonalStatistics( QgsVectorLayer *polygonLayer, QgsRasterLayer *rasterLayer, const QString &attributePrefix, int rasterBand, QgsZonalStatistics::Statistics stats )
      34                 :          0 :   : QgsZonalStatistics( polygonLayer,
      35                 :          0 :                         rasterLayer ? rasterLayer->dataProvider() : nullptr,
      36                 :          0 :                         rasterLayer ? rasterLayer->crs() : QgsCoordinateReferenceSystem(),
      37                 :          0 :                         rasterLayer ? rasterLayer->rasterUnitsPerPixelX() : 0,
      38                 :          0 :                         rasterLayer ? rasterLayer->rasterUnitsPerPixelY() : 0,
      39                 :          0 :                         attributePrefix,
      40                 :          0 :                         rasterBand,
      41                 :          0 :                         stats )
      42                 :            : {
      43                 :          0 : }
      44                 :            : 
      45                 :          0 : QgsZonalStatistics::QgsZonalStatistics( QgsVectorLayer *polygonLayer, QgsRasterInterface *rasterInterface,
      46                 :            :                                         const QgsCoordinateReferenceSystem &rasterCrs, double rasterUnitsPerPixelX, double rasterUnitsPerPixelY, const QString &attributePrefix, int rasterBand, QgsZonalStatistics::Statistics stats )
      47                 :          0 :   : mRasterInterface( rasterInterface )
      48                 :          0 :   , mRasterCrs( rasterCrs )
      49                 :          0 :   , mCellSizeX( std::fabs( rasterUnitsPerPixelX ) )
      50                 :          0 :   , mCellSizeY( std::fabs( rasterUnitsPerPixelY ) )
      51                 :          0 :   , mRasterBand( rasterBand )
      52                 :          0 :   , mPolygonLayer( polygonLayer )
      53                 :          0 :   , mAttributePrefix( attributePrefix )
      54                 :          0 :   , mStatistics( stats )
      55                 :            : {
      56                 :          0 : }
      57                 :            : 
      58                 :          0 : QgsZonalStatistics::Result QgsZonalStatistics::calculateStatistics( QgsFeedback *feedback )
      59                 :            : {
      60                 :          0 :   if ( !mRasterInterface )
      61                 :            :   {
      62                 :          0 :     return RasterInvalid;
      63                 :            :   }
      64                 :            : 
      65                 :          0 :   if ( mRasterInterface->bandCount() < mRasterBand )
      66                 :            :   {
      67                 :          0 :     return RasterBandInvalid;
      68                 :            :   }
      69                 :            : 
      70                 :          0 :   if ( !mPolygonLayer || mPolygonLayer->geometryType() != QgsWkbTypes::PolygonGeometry )
      71                 :            :   {
      72                 :          0 :     return LayerTypeWrong;
      73                 :            :   }
      74                 :            : 
      75                 :          0 :   QgsVectorDataProvider *vectorProvider = mPolygonLayer->dataProvider();
      76                 :          0 :   if ( !vectorProvider )
      77                 :            :   {
      78                 :          0 :     return LayerInvalid;
      79                 :            :   }
      80                 :            : 
      81                 :          0 :   QMap<QgsZonalStatistics::Statistic, int> statFieldIndexes;
      82                 :            : 
      83                 :            :   //add the new fields to the provider
      84                 :          0 :   int oldFieldCount = vectorProvider->fields().count();
      85                 :          0 :   QList<QgsField> newFieldList;
      86                 :          0 :   for ( QgsZonalStatistics::Statistic stat :
      87                 :          0 :         {
      88                 :            :           QgsZonalStatistics::Count,
      89                 :            :           QgsZonalStatistics::Sum,
      90                 :            :           QgsZonalStatistics::Mean,
      91                 :            :           QgsZonalStatistics::Median,
      92                 :            :           QgsZonalStatistics::StDev,
      93                 :            :           QgsZonalStatistics::Min,
      94                 :            :           QgsZonalStatistics::Max,
      95                 :            :           QgsZonalStatistics::Range,
      96                 :            :           QgsZonalStatistics::Minority,
      97                 :            :           QgsZonalStatistics::Majority,
      98                 :            :           QgsZonalStatistics::Variety,
      99                 :            :           QgsZonalStatistics::Variance
     100                 :            :         } )
     101                 :            :   {
     102                 :          0 :     if ( mStatistics & stat )
     103                 :            :     {
     104                 :          0 :       QString fieldName = getUniqueFieldName( mAttributePrefix + QgsZonalStatistics::shortName( stat ), newFieldList );
     105                 :          0 :       QgsField field( fieldName, QVariant::Double, QStringLiteral( "double precision" ) );
     106                 :          0 :       newFieldList.push_back( field );
     107                 :          0 :       statFieldIndexes.insert( stat, oldFieldCount + newFieldList.count() - 1 );
     108                 :          0 :     }
     109                 :            :   }
     110                 :            : 
     111                 :          0 :   vectorProvider->addAttributes( newFieldList );
     112                 :            : 
     113                 :          0 :   long featureCount = vectorProvider->featureCount();
     114                 :            : 
     115                 :          0 :   QgsFeatureRequest request;
     116                 :          0 :   request.setNoAttributes();
     117                 :            : 
     118                 :          0 :   request.setDestinationCrs( mRasterCrs, QgsProject::instance()->transformContext() );
     119                 :          0 :   QgsFeatureIterator fi = vectorProvider->getFeatures( request );
     120                 :          0 :   QgsFeature feature;
     121                 :            : 
     122                 :          0 :   int featureCounter = 0;
     123                 :            : 
     124                 :          0 :   QgsChangedAttributesMap changeMap;
     125                 :          0 :   while ( fi.nextFeature( feature ) )
     126                 :            :   {
     127                 :          0 :     ++featureCounter;
     128                 :          0 :     if ( feedback && feedback->isCanceled() )
     129                 :            :     {
     130                 :          0 :       break;
     131                 :            :     }
     132                 :            : 
     133                 :          0 :     if ( feedback )
     134                 :            :     {
     135                 :          0 :       feedback->setProgress( 100.0 * static_cast< double >( featureCounter ) / featureCount );
     136                 :          0 :     }
     137                 :            : 
     138                 :          0 :     QgsGeometry featureGeometry = feature.geometry();
     139                 :            : 
     140                 :          0 :     QMap<QgsZonalStatistics::Statistic, QVariant> results = calculateStatistics( mRasterInterface, featureGeometry, mCellSizeX, mCellSizeY, mRasterBand, mStatistics );
     141                 :            : 
     142                 :          0 :     if ( results.empty() )
     143                 :          0 :       continue;
     144                 :            : 
     145                 :          0 :     QgsAttributeMap changeAttributeMap;
     146                 :          0 :     for ( const auto &result : results.toStdMap() )
     147                 :            :     {
     148                 :          0 :       changeAttributeMap.insert( statFieldIndexes.value( result.first ), result.second );
     149                 :            :     }
     150                 :            : 
     151                 :          0 :     changeMap.insert( feature.id(), changeAttributeMap );
     152                 :          0 :   }
     153                 :            : 
     154                 :          0 :   vectorProvider->changeAttributeValues( changeMap );
     155                 :          0 :   mPolygonLayer->updateFields();
     156                 :            : 
     157                 :          0 :   if ( feedback )
     158                 :            :   {
     159                 :          0 :     if ( feedback->isCanceled() )
     160                 :          0 :       return Canceled;
     161                 :            : 
     162                 :          0 :     feedback->setProgress( 100 );
     163                 :          0 :   }
     164                 :            : 
     165                 :          0 :   return Success;
     166                 :          0 : }
     167                 :            : 
     168                 :          0 : QString QgsZonalStatistics::getUniqueFieldName( const QString &fieldName, const QList<QgsField> &newFields )
     169                 :            : {
     170                 :          0 :   QgsVectorDataProvider *dp = mPolygonLayer->dataProvider();
     171                 :            : 
     172                 :          0 :   if ( !dp->storageType().contains( QLatin1String( "ESRI Shapefile" ) ) )
     173                 :            :   {
     174                 :          0 :     return fieldName;
     175                 :            :   }
     176                 :            : 
     177                 :          0 :   QList<QgsField> allFields = dp->fields().toList();
     178                 :          0 :   allFields.append( newFields );
     179                 :          0 :   QString shortName = fieldName.mid( 0, 10 );
     180                 :            : 
     181                 :          0 :   bool found = false;
     182                 :          0 :   for ( const QgsField &field : std::as_const( allFields ) )
     183                 :            :   {
     184                 :          0 :     if ( shortName == field.name() )
     185                 :            :     {
     186                 :          0 :       found = true;
     187                 :          0 :       break;
     188                 :            :     }
     189                 :            :   }
     190                 :            : 
     191                 :          0 :   if ( !found )
     192                 :            :   {
     193                 :          0 :     return shortName;
     194                 :            :   }
     195                 :            : 
     196                 :          0 :   int n = 1;
     197                 :          0 :   shortName = QStringLiteral( "%1_%2" ).arg( fieldName.mid( 0, 8 ) ).arg( n );
     198                 :          0 :   found = true;
     199                 :          0 :   while ( found )
     200                 :            :   {
     201                 :          0 :     found = false;
     202                 :          0 :     for ( const QgsField &field : std::as_const( allFields ) )
     203                 :            :     {
     204                 :          0 :       if ( shortName == field.name() )
     205                 :            :       {
     206                 :          0 :         n += 1;
     207                 :          0 :         if ( n < 9 )
     208                 :            :         {
     209                 :          0 :           shortName = QStringLiteral( "%1_%2" ).arg( fieldName.mid( 0, 8 ) ).arg( n );
     210                 :          0 :         }
     211                 :            :         else
     212                 :            :         {
     213                 :          0 :           shortName = QStringLiteral( "%1_%2" ).arg( fieldName.mid( 0, 7 ) ).arg( n );
     214                 :            :         }
     215                 :          0 :         found = true;
     216                 :          0 :       }
     217                 :            :     }
     218                 :            :   }
     219                 :          0 :   return shortName;
     220                 :          0 : }
     221                 :            : 
     222                 :          0 : QString QgsZonalStatistics::displayName( QgsZonalStatistics::Statistic statistic )
     223                 :            : {
     224                 :          0 :   switch ( statistic )
     225                 :            :   {
     226                 :            :     case Count:
     227                 :          0 :       return QObject::tr( "Count" );
     228                 :            :     case Sum:
     229                 :          0 :       return QObject::tr( "Sum" );
     230                 :            :     case Mean:
     231                 :          0 :       return QObject::tr( "Mean" );
     232                 :            :     case Median:
     233                 :          0 :       return QObject::tr( "Median" );
     234                 :            :     case StDev:
     235                 :          0 :       return QObject::tr( "St dev" );
     236                 :            :     case Min:
     237                 :          0 :       return QObject::tr( "Minimum" );
     238                 :            :     case Max:
     239                 :          0 :       return QObject::tr( "Maximum" );
     240                 :            :     case Range:
     241                 :          0 :       return QObject::tr( "Range" );
     242                 :            :     case Minority:
     243                 :          0 :       return QObject::tr( "Minority" );
     244                 :            :     case Majority:
     245                 :          0 :       return QObject::tr( "Majority" );
     246                 :            :     case Variety:
     247                 :          0 :       return QObject::tr( "Variety" );
     248                 :            :     case Variance:
     249                 :          0 :       return QObject::tr( "Variance" );
     250                 :            :     case All:
     251                 :          0 :       return QString();
     252                 :            :   }
     253                 :          0 :   return QString();
     254                 :          0 : }
     255                 :            : 
     256                 :          0 : QString QgsZonalStatistics::shortName( QgsZonalStatistics::Statistic statistic )
     257                 :            : {
     258                 :          0 :   switch ( statistic )
     259                 :            :   {
     260                 :            :     case Count:
     261                 :          0 :       return QStringLiteral( "count" );
     262                 :            :     case Sum:
     263                 :          0 :       return QStringLiteral( "sum" );
     264                 :            :     case Mean:
     265                 :          0 :       return QStringLiteral( "mean" );
     266                 :            :     case Median:
     267                 :          0 :       return QStringLiteral( "median" );
     268                 :            :     case StDev:
     269                 :          0 :       return QStringLiteral( "stdev" );
     270                 :            :     case Min:
     271                 :          0 :       return QStringLiteral( "min" );
     272                 :            :     case Max:
     273                 :          0 :       return QStringLiteral( "max" );
     274                 :            :     case Range:
     275                 :          0 :       return QStringLiteral( "range" );
     276                 :            :     case Minority:
     277                 :          0 :       return QStringLiteral( "minority" );
     278                 :            :     case Majority:
     279                 :          0 :       return QStringLiteral( "majority" );
     280                 :            :     case Variety:
     281                 :          0 :       return QStringLiteral( "variety" );
     282                 :            :     case Variance:
     283                 :          0 :       return QStringLiteral( "variance" );
     284                 :            :     case All:
     285                 :          0 :       return QString();
     286                 :            :   }
     287                 :          0 :   return QString();
     288                 :          0 : }
     289                 :            : 
     290                 :          0 : QMap<QgsZonalStatistics::Statistic, QVariant> QgsZonalStatistics::calculateStatistics( QgsRasterInterface *rasterInterface, const QgsGeometry &geometry, double cellSizeX, double cellSizeY, int rasterBand, QgsZonalStatistics::Statistics statistics )
     291                 :            : {
     292                 :          0 :   QMap<QgsZonalStatistics::Statistic, QVariant> results;
     293                 :            : 
     294                 :          0 :   if ( geometry.isEmpty() )
     295                 :          0 :     return results;
     296                 :            : 
     297                 :          0 :   QgsRectangle rasterBBox = rasterInterface->extent();
     298                 :            : 
     299                 :          0 :   QgsRectangle featureRect = geometry.boundingBox().intersect( rasterBBox );
     300                 :            : 
     301                 :          0 :   if ( featureRect.isEmpty() )
     302                 :          0 :     return results;
     303                 :            : 
     304                 :          0 :   bool statsStoreValues = ( statistics & QgsZonalStatistics::Median ) ||
     305                 :          0 :                           ( statistics & QgsZonalStatistics::StDev ) ||
     306                 :          0 :                           ( statistics & QgsZonalStatistics::Variance );
     307                 :          0 :   bool statsStoreValueCount = ( statistics & QgsZonalStatistics::Minority ) ||
     308                 :          0 :                               ( statistics & QgsZonalStatistics::Majority );
     309                 :            : 
     310                 :          0 :   FeatureStats featureStats( statsStoreValues, statsStoreValueCount );
     311                 :            : 
     312                 :          0 :   int nCellsXProvider = rasterInterface->xSize();
     313                 :          0 :   int nCellsYProvider = rasterInterface->ySize();
     314                 :            : 
     315                 :            :   int nCellsX, nCellsY;
     316                 :          0 :   QgsRectangle rasterBlockExtent;
     317                 :          0 :   QgsRasterAnalysisUtils::cellInfoForBBox( rasterBBox, featureRect, cellSizeX, cellSizeY, nCellsX, nCellsY, nCellsXProvider, nCellsYProvider, rasterBlockExtent );
     318                 :            : 
     319                 :          0 :   featureStats.reset();
     320                 :          0 :   QgsRasterAnalysisUtils::statisticsFromMiddlePointTest( rasterInterface, rasterBand, geometry, nCellsX, nCellsY, cellSizeX, cellSizeY, rasterBlockExtent, [ &featureStats ]( double value ) { featureStats.addValue( value ); } );
     321                 :            : 
     322                 :          0 :   if ( featureStats.count <= 1 )
     323                 :            :   {
     324                 :            :     //the cell resolution is probably larger than the polygon area. We switch to precise pixel - polygon intersection in this case
     325                 :          0 :     featureStats.reset();
     326                 :          0 :     QgsRasterAnalysisUtils::statisticsFromPreciseIntersection( rasterInterface, rasterBand, geometry, nCellsX, nCellsY, cellSizeX, cellSizeY, rasterBlockExtent, [ &featureStats ]( double value, double weight ) { featureStats.addValue( value, weight ); } );
     327                 :          0 :   }
     328                 :            : 
     329                 :            :   // calculate the statistics
     330                 :          0 :   QgsAttributeMap changeAttributeMap;
     331                 :          0 :   if ( statistics & QgsZonalStatistics::Count )
     332                 :          0 :     results.insert( QgsZonalStatistics::Count, QVariant( featureStats.count ) );
     333                 :          0 :   if ( statistics & QgsZonalStatistics::Sum )
     334                 :          0 :     results.insert( QgsZonalStatistics::Sum, QVariant( featureStats.sum ) );
     335                 :          0 :   if ( featureStats.count > 0 )
     336                 :            :   {
     337                 :          0 :     double mean = featureStats.sum / featureStats.count;
     338                 :          0 :     if ( statistics & QgsZonalStatistics::Mean )
     339                 :          0 :       results.insert( QgsZonalStatistics::Mean, QVariant( mean ) );
     340                 :          0 :     if ( statistics & QgsZonalStatistics::Median )
     341                 :            :     {
     342                 :          0 :       std::sort( featureStats.values.begin(), featureStats.values.end() );
     343                 :          0 :       int size = featureStats.values.count();
     344                 :          0 :       bool even = ( size % 2 ) < 1;
     345                 :            :       double medianValue;
     346                 :          0 :       if ( even )
     347                 :            :       {
     348                 :          0 :         medianValue = ( featureStats.values.at( size / 2 - 1 ) + featureStats.values.at( size / 2 ) ) / 2;
     349                 :          0 :       }
     350                 :            :       else //odd
     351                 :            :       {
     352                 :          0 :         medianValue = featureStats.values.at( ( size + 1 ) / 2 - 1 );
     353                 :            :       }
     354                 :          0 :       results.insert( QgsZonalStatistics::Median, QVariant( medianValue ) );
     355                 :          0 :     }
     356                 :          0 :     if ( statistics & QgsZonalStatistics::StDev || statistics & QgsZonalStatistics::Variance )
     357                 :            :     {
     358                 :          0 :       double sumSquared = 0;
     359                 :          0 :       for ( int i = 0; i < featureStats.values.count(); ++i )
     360                 :            :       {
     361                 :          0 :         double diff = featureStats.values.at( i ) - mean;
     362                 :          0 :         sumSquared += diff * diff;
     363                 :          0 :       }
     364                 :          0 :       double variance = sumSquared / featureStats.values.count();
     365                 :          0 :       if ( statistics & QgsZonalStatistics::StDev )
     366                 :            :       {
     367                 :          0 :         double stdev = std::pow( variance, 0.5 );
     368                 :          0 :         results.insert( QgsZonalStatistics::StDev, QVariant( stdev ) );
     369                 :          0 :       }
     370                 :          0 :       if ( statistics & QgsZonalStatistics::Variance )
     371                 :          0 :         results.insert( QgsZonalStatistics::Variance, QVariant( variance ) );
     372                 :          0 :     }
     373                 :          0 :     if ( statistics & QgsZonalStatistics::Min )
     374                 :          0 :       results.insert( QgsZonalStatistics::Min, QVariant( featureStats.min ) );
     375                 :          0 :     if ( statistics & QgsZonalStatistics::Max )
     376                 :          0 :       results.insert( QgsZonalStatistics::Max, QVariant( featureStats.max ) );
     377                 :          0 :     if ( statistics & QgsZonalStatistics::Range )
     378                 :          0 :       results.insert( QgsZonalStatistics::Range, QVariant( featureStats.max - featureStats.min ) );
     379                 :          0 :     if ( statistics & QgsZonalStatistics::Minority || statistics & QgsZonalStatistics::Majority )
     380                 :            :     {
     381                 :          0 :       QList<int> vals = featureStats.valueCount.values();
     382                 :          0 :       std::sort( vals.begin(), vals.end() );
     383                 :          0 :       if ( statistics & QgsZonalStatistics::Minority )
     384                 :            :       {
     385                 :          0 :         double minorityKey = featureStats.valueCount.key( vals.first() );
     386                 :          0 :         results.insert( QgsZonalStatistics::Minority, QVariant( minorityKey ) );
     387                 :          0 :       }
     388                 :          0 :       if ( statistics & QgsZonalStatistics::Majority )
     389                 :            :       {
     390                 :          0 :         double majKey = featureStats.valueCount.key( vals.last() );
     391                 :          0 :         results.insert( QgsZonalStatistics::Majority, QVariant( majKey ) );
     392                 :          0 :       }
     393                 :          0 :     }
     394                 :          0 :     if ( statistics & QgsZonalStatistics::Variety )
     395                 :          0 :       results.insert( QgsZonalStatistics::Variety, QVariant( featureStats.valueCount.count() ) );
     396                 :          0 :   }
     397                 :            : 
     398                 :          0 :   return results;
     399                 :          0 : }

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